衛福部即將修訂《健保法》，針對二代健保的補充保費計算方式進行重大調整。未來薪資以外的利息、股利、租金等收入，將不再以「每月即時扣繳」為主，而改採「年度結算制」。也就是說，民眾若一年內這類收入合計超過兩萬元，將需繳交二點一一％的補充保費；此外，補充保費的扣繳上限也將從現行的一千萬元提高到五千萬元。此修法預計在二〇二七年上路，影響約四百八十萬人，可為健保增加一百至兩百億元收入。
衛福部長石崇良指出，現行制度容易被拆單規避，例如一千萬元存款若拆成十筆，每筆利息未達兩萬元，就能免扣補充保費。為避免這類漏洞，明年將推動修法，先從利息、股利、租金三項著手，採年度結算計算。
目前補充保費共有六類來源，包括利息、股利、租金、兼職收入、執行業務所得，以及基本薪資四倍以上的獎金。石崇良表示，高薪族群的四倍起徵點過高，導致實際徵收有限，因此也將修法調整為「最低基本工資」的四倍。例如以現行最低薪資二萬八千五百九十元計算，未來若獎金超過十一萬四千三百六十元，就必須繳納補充保費。
台灣醫務管理學會理事長洪子仁則提醒，改採年度結算後，政府需確保「保費看得到也收得到」，並建議同步調高政府的健保支出比率，從三十六％提升至三十八％，以減輕民眾負擔。
