川習會面後，美國明確表達不希望見到台灣獨立，使得民進黨的台獨黨綱重新引起各界關注。據《TVBS新聞網》報導，前民進黨立委林濁水18日於臉書分享往事，披露當年台獨立場差點被完全推翻，至今回想仍覺得既慶幸又驚險。
林濁水回顧，在1999年通過台獨黨綱決議文之前，當時作為總統候選人的陳水扁實際上是反對台獨路線的。2000年總統大選即將到來時，陳水扁曾經召開幹部秘密會議，試圖推動廢止台獨黨綱的計畫，核心主張相當明確：必須堅持中華民國國號。儘管林濁水與獨派人士當時清楚台獨支持者人數有限，但他們深怕取消黨綱會對台獨理念與台灣認同的長期發展造成負面影響，最終反而損害民進黨的前途。
林濁水進一步解釋，雖然中華民國國號確實是國內最廣泛的共識，但在國際舞台上大家普遍使用TAIWAN的稱呼，ROC與PRC容易產生混淆，對於全球化時代台灣品牌形象的塑造十分不利。他認為台獨黨綱擁有完整的理論基礎與建國構想，相比之下陳水扁的想法只考慮短期選舉效益，缺乏長期戰略規劃與核心價值。
為了解決黨內分歧，陳忠信建議採用決議文而非修正黨綱的做法來處理此事。林濁水在小組討論中堅持將主權、人民、政府、領土等國家構成要素寫進決議文，強調國號並非國家成立的必備條件，最終達成「台灣為主權獨立國家，目前國號為中華民國，但在國際上應維持彈性」的主要內容。不過扁系小組成員郭正亮對此極為不滿，認為決議文雖然承認中華民國國號，卻僅限於「現階段」使用，加上大篇幅論述主權獨立，等於掏空反台獨精神，事後多次公開提出不同意見。
林濁水感慨地說，現在台灣人的自我認同已經變成主流思維，民進黨在政黨競爭中取得優勢地位，回想當年台獨立場幾乎被廢除的危險時刻，除了感到慶幸外，至今仍心有餘悸。
